Orígenes y Etimología

 Este pueblo está situado en un área geográfica ocupada desde tiempos inmemoriales por tribus lencas, pero influenciadas en épocas más recientes por los chortis, pipiles y ulúas. Su nombre indígena actual es de origen náhuat y significa: "montaña de los quetzales", pues proviene de quetzal, nombre de un ave vernácula y sagrada de Centro América; y tepec, cerro, montaña, localidad. Dicha población está situada al pie del cerro de Carranchapal, vocablo del idioma ulúa que significa asimismo: "montaña de los quetzales", pues sus raíces constitutivas son carran, cerro, montaña, localidad; y chapal, quetzal, ave de plumas verdes resplandecientes.

Época Colonial

En 1550 esta población tenía unos 250 habitantes poco más o menos. El alcalde mayor de San Salvador don Manuel de Gálvez Corral, la menciona en 1740 con el kilométrico nombre de Nuestra Señora de la Concepción Quezaltepeque de la Sierra y le asigna una población de 22 jefes de familia o indios tributarios, es decir alrededor de 110 almas. Monseñor Pedro Cortés y Larraz, en 1770, dice que era pueblo anejo a la parroquia de Chalatenango, con una población de 239 personas repartidas en 58 familias. Ingresó en 1786 en el partido de Chalatenango. En 1807, según el corregidor intendente don Antonio Gutiérrez y Ulloa, Quezaltepeque era "Pueblo de indios a 2 leguas al N.E. (de) Chalatenango" y agrega que "incluye unas cuantas familias de Ladinos con 60 individuos de ambos sexos, y 1,060 los primeros" (es decir, de indios). Estos quezaltepequenses "Carecen de industria y todos están dedicados a las cosechas de añil y algunos maíces. Es camino para la jurisdicción de Gracias".

Sucesos posteriores

Por Ley de 18 de febrero de 1841 Concepción Quezaltepeque y La Junta formaron conjuntamente uno de los cantones electorales en que se dividió El Salvador. Esta población ha pertenecido de 1824 (12 de junio) a 1835 (22 de mayo) al departamento de San Salvador; de 1835 (22 de mayo) a 1855 (14 de febrero) al departamento de Cuzcatlán; y a partir de esta última fecha al departamento de Chalatenango. En 1890 su población se estimaba en 1,820 personas.

Título de Villa

Durante la administración del general don Maximiliano Hernández Martínez y por Decreto Legislativo de 6 de julio de 1938, se otorgó a este pueblo el título de villa.

Arqueología

 En la falda Oeste del cerro Cotei, en el paraje denominado La Cofradía, hay un petrograbado que asemeja una puerta.